”Дороро” ни пренася векове назад в Япония, в т. нар. епоха на Сенгоку. 48 ужасяващи демона, наричани ”маджини” (демони богове) сключват сделка със самурая Кагемутси Дайго – баща на все още неродено дете, което е предопределено да унищожи техния род. В замяна на тялото на неродения си син, което демоните разделят на 48 части ( за всеки демон по една част), самураят Дайго получава силата да побеждава във всяка битка и да властва над цяла Япония. След раждането на пожерваното дете Дайго го поставя в кошница и го пуска по течението на реката.
По случайност от там минава лекарят Джукай, който виждайки обезобразеното дете го взема със себе си. През следващите години той се посвещава на възстановяването на тялото на детето, използваики крайници и органи на загинали във непрестанните войни деца. Лекарят дава на момчето името Хиаккимару (в превод ”сторъкото страшилище”). Хиаккимару притежава свръхестествени сили, които му позволяват да вижда, говори и чува, въпреки че няма очи, уста или уши.
Вече пораснал, Хиаккимару, използвайки способностите си, тръгва на поход срещу демоните, отнели му тялото, като убивайки ги постепенно си възвръща органите. По вереме на пътешествието му към него се присъединява Дороро – жена воин, отгледана като мъж, провъзгласила се за ”най-умелия крадец в цяла Япония”.